Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Prdm1Q60636 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Prdm1Q60636 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Prdm1Q60636 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Prdm1Q60636 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Prdm1Q60636 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Prdm1Q60636 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Prdm1Q60636 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Prdm1Q60636 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Prdm1Q60636 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Prdm1Q60636 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Prdm1Q60636 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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