Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CttnQ60598 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CttnQ60598 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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CttnQ60598 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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CttnQ60598 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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CttnQ60598 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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CttnQ60598 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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CttnQ60598 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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CttnQ60598 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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CttnQ60598 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CttnQ60598 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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