Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms