Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tdrd5Q5VCS6 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tdrd5Q5VCS6 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tdrd5Q5VCS6 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tdrd5Q5VCS6 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tdrd5Q5VCS6 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tdrd5Q5VCS6 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms