Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms