Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddx49Q4FZF3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ddx49Q4FZF3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ddx49Q4FZF3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx49Q4FZF3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx49Q4FZF3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx49Q4FZF3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx49Q4FZF3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx49Q4FZF3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx49Q4FZF3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx49Q4FZF3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx49Q4FZF3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx49Q4FZF3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx49Q4FZF3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx49Q4FZF3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx49Q4FZF3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx49Q4FZF3 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx49Q4FZF3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx49Q4FZF3 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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