Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmub2Q3V209 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms