Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zmat1Q3V0C1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms