Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim40Q3UWA4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim40Q3UWA4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim40Q3UWA4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim40Q3UWA4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim40Q3UWA4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim40Q3UWA4 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim40Q3UWA4 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim40Q3UWA4 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim40Q3UWA4 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim40Q3UWA4 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim40Q3UWA4 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim40Q3UWA4 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim40Q3UWA4 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim40Q3UWA4 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms