Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Obox3Q3UT54 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms