Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms