Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms