Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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