Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.9 ms