Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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