Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rnf40Q3U319 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnf40Q3U319 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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