Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Otud5Q3U2S4 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otud5Q3U2S4 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otud5Q3U2S4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otud5Q3U2S4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otud5Q3U2S4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otud5Q3U2S4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Otud5Q3U2S4 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otud5Q3U2S4 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Otud5Q3U2S4 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otud5Q3U2S4 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Otud5Q3U2S4 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otud5Q3U2S4 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Otud5Q3U2S4 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otud5Q3U2S4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Otud5Q3U2S4 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otud5Q3U2S4 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otud5Q3U2S4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otud5Q3U2S4 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otud5Q3U2S4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otud5Q3U2S4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otud5Q3U2S4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otud5Q3U2S4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otud5Q3U2S4 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otud5Q3U2S4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otud5Q3U2S4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otud5Q3U2S4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otud5Q3U2S4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Otud5Q3U2S4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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