Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Rnf149Q3U2C5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Rnf149Q3U2C5 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Rnf149Q3U2C5 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Rnf149Q3U2C5 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Rnf149Q3U2C5 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Rnf149Q3U2C5 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Rnf149Q3U2C5 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Rnf149Q3U2C5 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Rnf149Q3U2C5 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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