Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ccndbp1Q3TVC7 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ccndbp1Q3TVC7 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms