Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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