Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Spatc1Q148B6 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms