Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms