Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pate4Q09098 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms