Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms