Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms