Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm15104-201ENSMUST00000132626 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Crem-229ENSMUST00000151084 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm17258-201ENSMUST00000168462 1266 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 AC154603.2-201ENSMUST00000223896 577 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms