Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Runx1Q03347 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms