Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms