Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GscQ02591 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GscQ02591 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GscQ02591 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GscQ02591 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GscQ02591 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GscQ02591 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GscQ02591 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GscQ02591 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GscQ02591 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GscQ02591 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GscQ02591 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
GscQ02591 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GscQ02591 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GscQ02591 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GscQ02591 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GscQ02591 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GscQ02591 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GscQ02591 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GscQ02591 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GscQ02591 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GscQ02591 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GscQ02591 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GscQ02591 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GscQ02591 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms