Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms