Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pde1bQ01065 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pde1bQ01065 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pde1bQ01065 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pde1bQ01065 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pde1bQ01065 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pde1bQ01065 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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