Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms