Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Scn1bP97952 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Scn1bP97952 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Scn1bP97952 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Scn1bP97952 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Scn1bP97952 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Scn1bP97952 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Scn1bP97952 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Scn1bP97952 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Scn1bP97952 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Scn1bP97952 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Scn1bP97952 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms