Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

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Length 3,329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Brca2P97929 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Brca2P97929 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Brca2P97929 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Brca2P97929 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Brca2P97929 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Brca2P97929 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Brca2P97929 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Brca2P97929 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Brca2P97929 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Brca2P97929 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Brca2P97929 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Brca2P97929 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Brca2P97929 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Brca2P97929 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Brca2P97929 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Brca2P97929 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Brca2P97929 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Brca2P97929 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Brca2P97929 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Brca2P97929 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Brca2P97929 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Brca2P97929 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Brca2P97929 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Brca2P97929 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Brca2P97929 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Brca2P97929 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Brca2P97929 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
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Brca2P97929 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Brca2P97929 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Brca2P97929 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Brca2P97929 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Brca2P97929 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Brca2P97929 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Brca2P97929 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Brca2P97929 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Brca2P97929 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Brca2P97929 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Brca2P97929 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Brca2P97929 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Brca2P97929 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Brca2P97929 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Brca2P97929 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Brca2P97929 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Brca2P97929 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Brca2P97929 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Brca2P97929 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Brca2P97929 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Brca2P97929 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Brca2P97929 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Brca2P97929 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Brca2P97929 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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