Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Ccdc116-202ENSMUST00000115709 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Fgf6-201ENSMUST00000000187 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 AC117656.2-201ENSMUST00000224931 2215 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 AC154171.3-201ENSMUST00000224519 2505 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 A730018C14Rik-201ENSMUST00000050754 2253 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms