Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme1P97371 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme1P97371 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme1P97371 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme1P97371 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme1P97371 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme1P97371 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme1P97371 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Psme1P97371 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme1P97371 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme1P97371 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms