Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Taf1bP97358 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Taf1bP97358 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Taf1bP97358 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Taf1bP97358 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Taf1bP97358 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Taf1bP97358 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Taf1bP97358 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Taf1bP97358 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Taf1bP97358 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Taf1bP97358 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Taf1bP97358 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Taf1bP97358 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Taf1bP97358 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Taf1bP97358 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Taf1bP97358 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Taf1bP97358 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Taf1bP97358 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Taf1bP97358 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Taf1bP97358 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Taf1bP97358 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms