Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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