Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx1P81068 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx1P81068 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx1P81068 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx1P81068 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx1P81068 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx1P81068 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx1P81068 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irx1P81068 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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