Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Irx3P81067 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irx3P81067 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms