Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CiitaP79621 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CiitaP79621 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CiitaP79621 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms