Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tra2bP62996 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms