Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra1P62812 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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