Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csrnp3P59055 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms