Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

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Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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