Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P58686 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms