Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa6P50704 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa6P50704 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms