Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpdP50404 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpdP50404 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms