Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpdP49429 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpdP49429 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpdP49429 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpdP49429 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpdP49429 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpdP49429 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpdP49429 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HpdP49429 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpdP49429 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpdP49429 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpdP49429 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpdP49429 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpdP49429 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HpdP49429 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms