Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms